名称  | 厂家  | 型号  | 
医用离心机  | 湖南凯达科学仪器有限公司  | TGL-18M  | 
荧光定量PCR仪  | ABI  | Stepone plus  | 
超净工作台  | 上海力辰邦西仪器科技有限公司  | SW-CJ-1D  | 
电泳仪  | 北京六一仪器厂  | DYY-7C  | 
离心管  | Axygen  | MCT-150-L-C  | 
TIP头  | Axygen  | |
PCR仪  | Applied Biosystems  | 2720 Thermal Cycler  | 
紫外仪  | 北京六一仪器厂  | WD-9403F  | 
优普系列超纯水机  | 四川优普超纯科技有限公司  | UPH-III-20T  | 
冷冻研磨仪  | 上海净信  | JXFSTPRP-CLN  | 
酶标仪  | BioTek  | SYNERGY LX multi-mode reader  | 
名称  | 厂家  | 型号  | 
AceQ Universal SYBR qPCR Master Mix  | 南京诺唯赞生物科技有限公司  | Q511-02  | 
HiScript II 1st Strand cDNA Synthesis Kit (+gDNA wiper)  | 南京诺唯赞生物科技有限公司  | R212-02  | 
琼脂糖  | 擎科生物  | TSJ001  | 
无水乙醇  | 国药集团化学试剂有限公司  | 10009218  | 
Gold view  | 北京艾德莱生物科技有限公司  | EP0601  | 
Trans2K®Plus II DNA Marker  | 北京全式金生物技术股份有限  | BM121-01  | 
三氯甲烷  | 国药集团化学试剂有限公司  | 10006818  | 
异丙醇  | 国药集团化学试剂有限公司  | 80109218  | 
TRIpure Reagent  | 北京艾德莱生物科技有限公司  | RN0102  | 
DEPC  | 上海生工  | B600154-0025  | 
1、总RNA抽提: 样本前处理。
1.1、组织:取匀浆管,加入1ml的TRIpure Reagent,置冰上预冷。取约20 mg组织,加入到匀浆管中。匀浆仪充分研磨直至无可见组织块。
1.2.贴壁细胞:将培养瓶/板中培养液尽弃,加入1ml 4℃ 预冷的PBS溶液,轻摇洗涤。除去PBS,加入1ml的TRIpure Reagent,轻缓振荡或用枪头吹打,破碎细胞。
1.3.悬浮细胞:3000 rpm,离心10分钟,收集细胞沉淀,加入1ml 4℃ 预冷的PBS溶液重悬细胞,3000 rpm,离心10分钟,收集细胞沉淀,加入1ml的TRIpure Reagent,轻缓振荡或用枪头吹打,破碎细胞。
2. 相分离:加入200 μl三氯甲烷,颠倒充分混匀,静置3min,4℃ 下12000rpm离心10min,将400 μl上清转移到一新的离心管中。TBST清洗切片,浸洗3次,每次5分钟。
3、洗涤RNA:吸除液体,加入1ml 75%乙醇洗涤沉淀。4℃下12000rpm离心5min,将液体吸除干净。
4、溶解RNA:将离心管置于超净台上吹3min,加入30μl DEPC水溶解RNA,55℃ 孵育5min。
5、RNA质量检测:用酶标仪检测RNA浓度及纯度,电泳检测RNA的完整行。
6、反转录
基因组DNA去除
Component  | Volume  | 
4 × gDNA wiper Mix  | 4 μL  | 
Oligo (dT)23VN (50 µM)  | 1 μL  | 
Random hexamers (50 ng/µl)  | 1 μL  | 
Total RNA  | 10 pg-1 μg  | 
RNase free water  | Add to 16 μL  | 
用移液器轻轻吹打混匀。42℃ 2 min。
7、配制第一链cDNA合成反应液。
Component  | Volume  | 
上一步的混合液  | 16 μL  | 
10 × RT Mix  | 2 μL  | 
HiScript II Enzyme Mix  | 2 μL  | 
8、逆转录程序设置
Temperature  | Time  | 
50℃  | 15min  | 
85℃  | 2min  | 
9、荧光定量PCR实验步骤
9.1 引物的配制
9.1.1 将引物瞬时离心;
9.1.2 按照说明书加入去离子水,加盖混匀,配成100uM/L的贮存液;
9.1.3 另取一EP管,将上、下游引物稀释为10.0uM/L终浓度的工作液。
10、cDNA的配置:将cDNA从冰箱中取出,加入适量的去离子水,稀释至合适的浓度。
11、反应体系:取0.2ml PCR管,配制如下反应体系,每个反转录产物配制3管。
Component  | Volume  | 
AceQ Universal SYBR qPCR Master Mix  | 10μl  | 
上游引物  | 0.4uL  | 
下游引物  | 0.4uL  | 
ddH2O  | 6.7μl  | 
DNA(适度稀释)  | 2.5μl  | 
DNA(适度稀释)  | 2.5μl  | 
总体系  | 20μl  | 
12、荧光定量PCR实验步骤:95℃ 5min;(95℃ 10s ;60℃ 30s)40次熔解曲线 60℃→95℃,每15s升温0.3℃
1、ΔΔCT法:A=CT(目的基因,待测样本)- CT(内标基因,待测样本);B=CT(目的基因,对照样本)- CT(内标基因,对照样本);K=A-B 表达倍数=2-K

        
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