名称 | 厂家 | 型号 |
医用离心机 | 湖南凯达科学仪器有限公司 | TGL-18M |
荧光定量PCR仪 | ABI | Stepone plus |
超净工作台 | 上海力辰邦西仪器科技有限公司 | SW-CJ-1D |
电泳仪 | 北京六一仪器厂 | DYY-7C |
离心管 | Axygen | MCT-150-L-C |
TIP头 | Axygen | |
PCR仪 | Applied Biosystems | 2720 Thermal Cycler |
紫外仪 | 北京六一仪器厂 | WD-9403F |
优普系列超纯水机 | 四川优普超纯科技有限公司 | UPH-III-20T |
冷冻研磨仪 | 上海净信 | JXFSTPRP-CLN |
酶标仪 | BioTek | SYNERGY LX multi-mode reader |
名称 | 厂家 | 型号 |
AceQ Universal SYBR qPCR Master Mix | 南京诺唯赞生物科技有限公司 | Q511-02 |
HiScript II 1st Strand cDNA Synthesis Kit (+gDNA wiper) | 南京诺唯赞生物科技有限公司 | R212-02 |
琼脂糖 | 擎科生物 | TSJ001 |
无水乙醇 | 国药集团化学试剂有限公司 | 10009218 |
Gold view | 北京艾德莱生物科技有限公司 | EP0601 |
Trans2K®Plus II DNA Marker | 北京全式金生物技术股份有限 | BM121-01 |
三氯甲烷 | 国药集团化学试剂有限公司 | 10006818 |
异丙醇 | 国药集团化学试剂有限公司 | 80109218 |
TRIpure Reagent | 北京艾德莱生物科技有限公司 | RN0102 |
DEPC | 上海生工 | B600154-0025 |
1、总RNA抽提: 样本前处理。
1.1、组织:取匀浆管,加入1ml的TRIpure Reagent,置冰上预冷。取约20 mg组织,加入到匀浆管中。匀浆仪充分研磨直至无可见组织块。
1.2.贴壁细胞:将培养瓶/板中培养液尽弃,加入1ml 4℃ 预冷的PBS溶液,轻摇洗涤。除去PBS,加入1ml的TRIpure Reagent,轻缓振荡或用枪头吹打,破碎细胞。
1.3.悬浮细胞:3000 rpm,离心10分钟,收集细胞沉淀,加入1ml 4℃ 预冷的PBS溶液重悬细胞,3000 rpm,离心10分钟,收集细胞沉淀,加入1ml的TRIpure Reagent,轻缓振荡或用枪头吹打,破碎细胞。
2. 相分离:加入200 μl三氯甲烷,颠倒充分混匀,静置3min,4℃ 下12000rpm离心10min,将400 μl上清转移到一新的离心管中。TBST清洗切片,浸洗3次,每次5分钟。
3、洗涤RNA:吸除液体,加入1ml 75%乙醇洗涤沉淀。4℃下12000rpm离心5min,将液体吸除干净。
4、溶解RNA:将离心管置于超净台上吹3min,加入30μl DEPC水溶解RNA,55℃ 孵育5min。
5、RNA质量检测:用酶标仪检测RNA浓度及纯度,电泳检测RNA的完整行。
6、反转录
基因组DNA去除
Component | Volume |
4 × gDNA wiper Mix | 4 μL |
Oligo (dT)23VN (50 µM) | 1 μL |
Random hexamers (50 ng/µl) | 1 μL |
Total RNA | 10 pg-1 μg |
RNase free water | Add to 16 μL |
用移液器轻轻吹打混匀。42℃ 2 min。
7、配制第一链cDNA合成反应液。
Component | Volume |
上一步的混合液 | 16 μL |
10 × RT Mix | 2 μL |
HiScript II Enzyme Mix | 2 μL |
8、逆转录程序设置
Temperature | Time |
50℃ | 15min |
85℃ | 2min |
9、荧光定量PCR实验步骤
9.1 引物的配制
9.1.1 将引物瞬时离心;
9.1.2 按照说明书加入去离子水,加盖混匀,配成100uM/L的贮存液;
9.1.3 另取一EP管,将上、下游引物稀释为10.0uM/L终浓度的工作液。
10、cDNA的配置:将cDNA从冰箱中取出,加入适量的去离子水,稀释至合适的浓度。
11、反应体系:取0.2ml PCR管,配制如下反应体系,每个反转录产物配制3管。
Component | Volume |
AceQ Universal SYBR qPCR Master Mix | 10μl |
上游引物 | 0.4uL |
下游引物 | 0.4uL |
ddH2O | 6.7μl |
DNA(适度稀释) | 2.5μl |
DNA(适度稀释) | 2.5μl |
总体系 | 20μl |
12、荧光定量PCR实验步骤:95℃ 5min;(95℃ 10s ;60℃ 30s)40次熔解曲线 60℃→95℃,每15s升温0.3℃
1、ΔΔCT法:A=CT(目的基因,待测样本)- CT(内标基因,待测样本);B=CT(目的基因,对照样本)- CT(内标基因,对照样本);K=A-B 表达倍数=2-K
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